فناوری جدید قدرت توالی یابی را برای کمک به رمزگشایی ژنوم تمام حیات روی زمین افزایش می دهد

به گزارش پایگاه اطلاع رسانی ایران رصد، از آنجایی که پروژه بیو ژنوم زمین (EBP) برای توالی‌بندی، فهرست‌نویسی و مشخص کردن ژنوم‌های همه تنوع زیستی یوکاریوتی روی زمین در ده سال آینده شتاب بیشتری می‌گیرد، تلاش‌های جهانی برای استقرار فناوری و زیرساخت‌هایی در حال انجام است که قادر به ارائه سریع تعداد زیادی از این گونه‌ توالی های ژنومی با کیفیت هستند.

پلتفرم Sequel IIe دانشمندان را قادر می‌سازد تا تجزیه و تحلیل ژنومی را با تولید خواندن‌های طولانی با وفاداری بالا (HiFi) برای حل ژنوم ها و رونوشت‌ها به سطح بالاتری از دقت برسانند.

دکتر کریم غربی، رئیس بخش لوله‌های ژنومیکس در موسسه Earlham، گفت: پلتفرم‌های Sequel IIe به ما این امکان را می‌دهند. که زیرساخت‌های موجود خود را در سهم خود در توالی‌یابی BioGenome افزایش دهیم. تقاضا از سوی جامعه علوم زیستی بریتانیا برای ارجاعات ژنومی با کیفیت بالاتر به سرعت در حال رشد است. و درخواست‌ها برای دسترسی به داده‌های توالی HiFi در بالاترین حد خود قرار دارند.

پلتفرم های Sequel IIe در موسسه Earlham

«بازخورد از پذیرندگان اولیه Sequel IIe در سراسر جامعه ژنومیک در مورد ژنوم های HiFi بسیار مثبت بوده است. و حداقل یک مرتبه از منابع موجود بهتر است. پلتفرم اضافی بلافاصله ظرفیت قابلیت توالی ژنوم ما را دو برابر خواهد کرد. امکان دسترسی مداوم و مقرون به صرفه به خواندن HiFi را برای محققان EI و دانشمندان زیستی بریتانیا فراهم می کند.

در چند سال گذشته، مؤسسه Earlham سرمایه‌گذاری‌های استراتژیک در فناوری‌های فعال‌کننده ژنوم انجام داده است. و مسیری را برای عصر جدیدی در زیست‌شناسی ایجاد کرده است. که در آن توالی‌های ژنومی با کیفیت بالا و حاشیه‌نویسی غنی دیگر استثنا نیستند، بلکه به طور فزاینده‌ای عادی هستند.

پروفسور نیل هال، مدیر موسسه Earlham، اضافه کرد: «ابتکارات پروژه Earth BioGenome بسیار مشارکتی است. اما فناوری و زیرساختی که قادر به تولید ژنوم‌های با کیفیت بالا در مقیاس است، باید تضمین شود. ظرفیت اضافی HiFi در مؤسسه Earlham برای تجزیه و تحلیل ژنوم های پروتیست، موقعیت ما را در ابتکار عمل جهانی به عنوان یک رهبر در توالی یابی ژنوم تقویت می کند.

این فناوری‌های توالی‌یابی از چندین طرح ملی و بین‌المللی با مؤسسه Earlham به عنوان شریک تحقیقاتی اصلی پشتیبانی می‌کنند.( از جمله پروژه ژنوم مهره‌داران، پروژه درخت زندگی داروین (DTOL) و اطلس ژنوم مرجع اروپایی (ERGA). ) ارائه داده‌های توالی‌یابی کلیدی و تجزیه و تحلیل برای طیف گسترده ای از ارگانیسم ها، و زیربنای برنامه بلندپروازانه برای فهرست بندی تنوع زیستی یوکاریوت های تک سلولی (پروتیست ها).*

دکتر غربی افزود: «کلید این سرمایه‌گذاری، پذیرش زودهنگام پلتفرم توالی‌یابی طولانی و با کیفیت (HiFi) (Pacific Biosciences Sequel II) در سال ۲۰۱۹ بود. قبل از اینکه مؤسسه Earlham به طور دائم این ابزار را با حمایت مالی BBSRC خریداری کند. این فناوری به محققان مؤسسه اجازه داد تا موفقیت اولیه را در ارائه ارجاعات ژنومی با کیفیت بالا برای گونه‌های هدف کلیدی تضمین کنند. و EI را به عنوان مرکز پیشرو در تحقیقات BioGenome ایجاد کنند.

*موسسه Earlham oL به عنوان بخشی از پروژه DTبا بودجه Wellcome، توسعه ابزارهای جدیدی را برای ساخت ژنوم های با کیفیت بالا از یوکاریوت های تک سلولی هدایت می کند. محور اصلی این فناوری سکوها و خطوط لوله برای گونه های پروتیست جدا شده از جمعیت های محیطی برای افزایش کارایی و کاهش هزینه های آماده سازی کتابخانه از سلول های منفرد است.